Разница - в процессе создания. Определенные движения рук были замечены у Вирджинии Сатир, потом стало понятно, зачем она их делает и в самую последнюю очередь было придумано слово - якорь. Это - моделирование.
Про субмодальности я точно не знаю (могу только предположить), ну давай рассмотрим модальности для простоты - про них все известно. Гриндер и Бэндлер сначала их заметили, а потом придумали название, а потом способ ими манипулировать. Это - дизайн.