Метаконтроллёром упражнений лаборатории МП является metanymous.

Это ситуация вынужденная. По хорошему м. контроллер должен быть среди вас. И это роль сменная.

Имеет ли смысл прямо in-house метаконтроллёра иметь

Имеет.

(а таким образом metanymouse становится meta-metaperson :) )?

А метанимус он и есть метанимус.

Или лучше будет разделить роли контроллёров не по уровням «мета», а по функциям?

ПО функциям, и тем по уровням.

(Один следит например за основной процедурой, второй за какой-нибудь вспомогательной типа раппорта или ОФ.)

Контроллер следит за ходом процесса, а м. контроллер отслеживает, например подводящие и посгипнотические/проходящие в будущее пресуппозиции. Но, функций надо набрать больше для м. контроллера.