что бы услышать основной тон надо вначале услышать множество тонов, пусть даже не выделяя никак отдельный тон

Что конкретно надо сделать, чтобы услышать множество тонов?

а выделение из этих тонов основного тона это уже следующий тренируемый навык

Я думаю, это более-менее тривиальный шаг.

В идеале выделение основного тона делать в упражнении, где надо на инструменте повторить ноту, при этом подбор ноты происходит уже другим тембром.

Думаю, такая тренировка потребует неоправданно больших затрат времени. Но попробуйте, почему нет, будет интересно узнать о результате.