Давайте просто переносить в новую ветку каждый раз, когда комментарии становится неудобно читать. Если делать как предлагаете вы это будет запутывать привычных к ЖЖ-интерфейсу читателей. Плюс невозможно будет отвечать из интерфейса почтовых уведомлений, потому что не будет видно на какой комментарий пришел ответ. Плюс придется что-то выдумывать, если надо будет начать новую ветку вопрошания.