...  ↑

У Бэйтсона в Экологии Разума есть металог именно про инстинкты. Возможно он прояснит часть твоих вопросов. Если что, пость сюда отрывки, обсудим. Если смотреть с точки зрения эмерджентности, то программы коммуникации - следствия сочетания более простых "программ".
То есть сигналы в гены могут быть заложены косвенно.